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2018年09月10日 12時12分 JST | 更新 2018年09月10日 12時12分 JST

RNAのスナップショットをつなぎ合わせて細胞系譜を示す

単一細胞のRNAプロファイルというスナップショットに基づいて、細胞事象や発生における細胞系譜の時間的順序を決定することは、単一細胞を用いる手法での大きな難題の1つである。

単一細胞のRNAプロファイルというスナップショットに基づいて、細胞事象や発生における細胞系譜の時間的順序を決定することは、単一細胞を用いる手法での大きな難題の1つである。今回P Kharchenkoたちは、スプライシングを受けていないmRNAとスプライシングを受けたmRNAの比を解析して、遺伝子発現状態の時間微分を決定し、細胞の時間的順序付けを行うことで、この問題を解決できると提案している。彼らは、発表されているさまざまなデータセットにおいてこの方法を検証し、この方法を用いて、マウス海馬での分岐決定を明らかにし、ヒト胎児脳でのRNA変化を解析している。

Nature560, 7719

原著論文: RNA velocity of single cells

doi: 10.1038/s41586-018-0414-6

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Nature 2018年8月23日 Volume 560 Issue 7719